Στον τρόπο εκλογής του Αρχιεπισκόπου Χρυσοστόμου, που είχε φτάσει την ανώτατη εκκλησιαστική ηγεσία στα όρια του "σχίσματος" και του διχασμού και που παρέσυρε μαζί και τους πιστούς των τότε υποψηφίων για τον αρχιεπισκοπικό θώκο, επικεντρώθηκε ο Κυπριακός Τύπος το 2006.
Η εκλογή του τότε Μητροπολίτη Πάφου στη θέση του Αρχιεπισκόπου, όπως διαφάνηκε ήταν προϊόν συμφωνίας. Ο ίδιος, λίγους μήνες νωρίτερα και συγκεκριμένα το Ιούνιο που προηγήθηκε είχε δηλώσει πως «και ο επόμενος Αρχιεπίσκοπος Κύπρου Χρυσόστομος θα είναι», ωστόσο όπως φάνηκε εκ του αποτελέσματος, λίγοι τον πίστεψαν.
Το αποτέλεσμα αυτής, ο από Μητροπολίτης Πάφου, Αρχιεπίσκοπος Κύπρου αφού συμμάχησε αρχικά με τον Μητροπολίτη Λεμεσού Αθανάσιο, για να αφήσουν εκτός διαδικασίας τον Επίσκοπο Κύκκου Νικηφόρο, 24 ώρες αργότερα μετέτρεψε σε υποστηρικτή του τον Επίσκοπο Κύκκου και με τις ψήφους του εξελέγη Προκαθήμενος της Εκκλησίας της Κύπρου ανατρέποντας προγνωστικά, τις δημοσκοπήσεις και τις αναλύσεις.
Επικριτικός ο Τύπος
Με τίτλους όπως «Με ιερή συμφωνία εξελέγη ο Πάφου», «Οι 5 όροι του Κύκκου», «Παρασκήνιο μέχρι την ύστατή, «Ο Νικηφόρος βγάζει Αρχιεπίσκοπο», και «Χαίνουσα η πληγή στο Σώμα της Εκκλησίας», ο τύπος της εποχής κάλυψε την εκλογή του τότε Μητροπολίτη Πάφου.
Άρθρο της εφημερίδας η Χαραυγή με τίτλο «Η Δημοκρατία Πάσχει στους Κόλπους της Εκκλησίας» σημείωνε τα εξής. «Φαίνεται πως η έννοια της δημοκρατίας και ο σεβασμός προς την ετυμηγορία του λαού περνούν μια κρίση στους κόλπους της Εκκλησίας». Όπως αναφέρει το άρθρο της εφημερίδας, «το παρασκήνιο, με πρωταγωνιστή τον Τοποτηρητή του αρχιεπισκοπικού θώκου, μητροπολίτη Πάφου να εκμαιεύσει δεσμεύσεις από τους δυο άλλους υποψηφίους για να τον υποστηρίξουν στο ύπατο αξίωμα της Εκκλησίας, επιβεβαιώνει του λόγου το αληθές».
Το πρωτοσέλιδο δημοσίευμα της εφημερίδας «Ο Φιλελεύθερος» έκανε λόγο σε «αλληλομαχαιρώματα», σύγχυση, αδιέξοδα, αποκλεισμούς και αφορισμούς. Όπως αναφέρει το δημοσίευμα της εφημερίδας, «η ηγεσία της εκκλησίας καθώς και το εκκλησιαστικό ποίμνιο έφτασε στα όρια του διχασμού». Οι χειρισμοί που έγιναν για την ανάδειξη του νέου αρχιεπισκόπου Νέας Ιουστιανιανής και Πάσης Κύπρου άφησαν ανεπανόρθωτα εκτεθειμένους τους πολίτες για τα όσα τεκταίνονται στους κόλπους της Εκκλησίας. Η Εκκλησία της Κύπρου, μένει με ανοιχτές της πληγές της και αβέβαιο το τι μπορεί να επακολουθήσει αφού οι ιεράρχες αντάλλαξαν μαχαιριές για μεθοδεύσεις, προκειμένου να αναδείξουν τον «εκλεκτό» τους στον αρχιεπισκοπικό θρόνο.
Με τίτλο «Ο Νικηφόρος βγάζει Αρχιεπίσκοπο» κυκλοφόρησε η εφημερίδα «η σημερινή». Στο ρεπορτάζ η εφημερίδα σημειώνει πως η αναβολή στέρησε από τον Αθανάσιο τον αρχιεπισκοπικό θρόνο.
Οι ψηφοφορίες
Για την ιστορία να αναφέρουμε τα εξής.
Στην πρώτη ψηφοφορία, όπου στην κάλπη των γενικών αντιπροσώπων, των εκπροσώπων των πιστών, πήρε 46 ψήφους, με τον Μητροπολίτη Λεμεσού Αθανάσιο να λαμβάνει 45 και τον Μητροπολίτη Πάφου Χρυσόστομο 9. Στην κάλπη των εξ οφίκιο εκπροσώπων ο Επίσκοπος Κύκκου πήρε 11 ψήφους, ο Λεμεσού 7 και ο κ. Χρυσόστομος 12.
Στην κάλπη των εξ οφίκιο, η οποία θα αναδείκνυε τον δεύτερο υποψήφιο Αρχιεπίσκοπο, ο Μητροπολίτης Λεμεσού ενίσχυσε τον Μητροπολίτη Πάφου κ. Χρυσόστομο. Είναι χαρακτηριστικό ότι ο κ. Αθανάσιος, ο οποίος στην πρώτη ψηφοφορία στη συγκεκριμένη κάλπη είχε λάβει 7 ψήφους, στη δεύτερη πήρε μόνο τρεις, ο Επίσκοπος Κύκκου 12 και ο Μητροπολίτης Πάφου 16 από 12 που είχε αρχικά.
Μέσα σε αυτό το πλαίσιο τελικοί υποψήφιοι αναδείχθηκαν οι Μητροπολίτες Πάφου και Λεμεσού και ο Επίσκοπος Κύκκου έμεινε εκτός εκλογικής διαδικασίας, παρ’ ότι οι 58 από τους 131 εκλέκτορες στήριξαν την υποψηφιότητά του. Αντίθετα, διεκδικητής του Θρόνου αναδεικνυόταν ένας Ιεράρχης, ο Πάφου Χρυσόστομος, ο οποίος είχε μόλις 21 ψήφους.
